Respiratory pathogens in children with acute lower respiratory infection detected through multiplex real-time PCR / Patógenos respiratorios en niños con infección respiratoria aguda baja detectados mediante PCR multiplex en tiempo real

Abstract Introduction: Acute respiratory infection in children has a high burden of disease. Detection of multiple micro -organisms through molecular testing of nasopharyngeal swab samples could change the paradigm of a single pathogen being the cause of respiratory disease in children and prove its usefulness in clinical practice. Objective: To characterize the pathogens identified in nasopharyngeal swab samples by means of multiplex realtime polymerase chain reaction (RT-PCR), as well as clinical variables and laboratory findings in children <5 years diagnosed with acute lower respiratory tract infection (ALRTI) and hospitalized in Bogotá D.C., Colombia. Materials and methods: Cross-sectional study conducted in 81 children hospitalized between September 2019 and March 2020 at the Clínica Cafam and in whom nasopharyngeal swab samples were collected for microbiological identification using the Allplex™ multiplex RT-PCR assay. Correlations between the number of pathogens and blood cells and C-reactive protein levels were determined by Spearman's rank correlation coefficient. Results: Patients' mean age was 17.23 months (±14.44), 54.32% were males, and 51.85% were young infants. A total of 149 microorganisms (60.40% viruses) were identified in 63 children (77.78%). Mixed infection and coinfection were reported in 48.15% and 11.11% of children, respectively. Regarding clinical findings, shortness of breath, upper airway obstruction, cough, fever and pharyngitis were the most common clinical signs and/or symptoms in patients with mixed infection (32.97%), coinfection (64.40%), mixed infection (29.78%), and absence of microorganism (22.00%), respectively. A negative correlation was observed between the number of leukocytes and the number of neutrophils and the number of microorganisms detected in the preschoolers group (r=-0.46; p =0.058 and r=-0.51; p =0.033, respectively). Furthermore, a positive correlation was found between monocyte count and the number of microorganisms detected (r=0.53; p =0.0096). Conclusion: Multiplex RT-PCR assay allowed the identification of microorganisms in most children, as well as cases of mixed infection and coinfection in more than half of the sample. In addition, clinical findings in these children were highly heterogeneous as per the assay result..

Resumen Introducción. La infección respiratoria aguda en niños tiene una alta carga de enfermedad. La detección de múltiples microorganismos a través de pruebas moleculares en hisopados nasales podría cambiar el paradigma de patógeno único causal de enfermedad respiratoria en niños y ser de utilidad en la práctica clínica. Objetivo. Caracterizar los patógenos identificados mediante la técnica de reacción en cadena de polimerasa multiplex en tiempo real (RT-PCR) en hisopado nasal, así como las variables clínicas y los resultados de laboratorio en niños <5 años diagnosticados con infección respiratoria aguda baja (IRAB) y hospitalizados en Bogotá D.C., Colombia. Materiales y métodos. Estudio transversal realizado en 81 niños hospitalizados entre septiembre de 2019 y marzo de 2020 en la clínica Cafam y en quienes se hizo hisopado nasal para realizar la identificación microbiològica mediante la prueba RT-PCR multiplex Allplex. Las correlaciones entre el número de patógenos y los niveles de células del hemograma y el nivel de proteína C reactiva se determinaron mediante el coeficiente de correlación de Spearman. Resultados. La edad promedio fue 17.23 meses (±14.44), 54.32% fueron varones y 51.85%, lactantes menores. Se identificaron 149 microorganismos (60.40% virus) en 63 niños (77.78%). Hubo infección mixta en el 48.15% y coinfección en 11.11% de los niños. Respecto a los hallazgos clínicos, la dificultad respiratoria, la obstrucción de la vía respiratoria alta, la tos, la fiebre y la faringitis fueron más comunes en los casos de infección mixta (32.97%), ausencia de microorganismo (16.00%), coinfección (64.40%), infección mixta (29.78%) y ausencia de microorganismo (22.00%), respectivamente. Se observó una correlación negativa entre el número de leucocitos y neutrófilos y el número de microorganismos detectados en preescolares (r=-0.46; p=0.058 y r=-0.51; p=0.033) y una positiva entre el recuento de monocitos y el número de microorganismos detectados (r=0.53; p =0.0096). Conclusión. La prueba RT-PCR multiplex permitió identificar microorganismos en la mayoría de niños, así como casos de infección mixta y coinfección en más de la mitad de la muestra. Además, los hallazgos clínicos fueron altamente heterogéneos entre los niños según el resultado de la prueba.

HLA and skin cancer / HLA e câncer de pele

Skin cancer - melanoma and non melanoma - are common neoplasm with rising incidence over the last decades. It is an important public health problem. Its pathogenesis is not completely understood and the same happens with the genetic factors involved. The genes that encode the HLA are associated with some tumors and they may be responsible for one of the mechanisms that take part in the development of the before mentioned cancers. We have reviewed the literature on the subject of HLA antigens, melanoma and non melanoma skin cancer.

Os cânceres da pele - melanoma e não-melanoma - são neoplasias comuns e com incidência crescente ao longo de décadas. Representam um importante problema de saúde pública. A patogênese destas neoplasias não é completamente compreendida, assim como não o são os fatores genéticos envolvidos. Os genes HLA estão associados a alguns tumores e podem representar um dos mecanismos implicados no desenvolvimento do câncer de pele. Apresenta-se uma revisão atualizada sobre a relação entre antígenos HLA, câncer da pele não-melanoma e melanoma.

Evaluación de la concordancia endocópica y anatomopatológica de la cromoendoscopia con azul de metileno en el diagnóstico de la metaplasia gástrica duodenal: resultados preliminares / Evaluation of the agreement endocopic and anatomopatologyc of the cromoendoscopia with blue of metileno in the diagnosis of the metaplasia gastric duodenal: preliminary results

Determinar la frecuencia de metaplasia gástrica duodenal en nuestra población. Evaluar la concordancia endoscópica utilizando el azul de metileno (AM) y su relación histológica con Hematoxilina y Eosina (HE) y Ácido Periódico de Schiff (PAS) para identificar la metaplasia gástrica duodenal (MGD). Evaluamos pacientes con síntomas de dispepsia entre abril-mayo 2003 los cuales fueron seleccionados en este estudio. Se realizó endoscopia y 10 cc de AM al 1 por ciento fue instilada en el bulbo duodenal, se tomó biopsia de las áreas que no se tiñeron con pinza de biopsia convencional. La muestra se clasificó en tres grupos: Grupo I: mucosa de apariencia normal, grupo II: duodenitis: tipo I hiperemica, tipo II erosiva y tipo III rugosa, áspera (Clasificación de Tanaka) y grupo III con ulcera en duodeno. De un total de 43 pacientes, el 86 por ciento (n=24) perteneció al sexo masculino; con un promedio (X) de edad de 41,62 años y el 44 por ciento (n=19) al femenino con un X de edad de 45,15 años. La epigastralgia fue el síntoma mas frecuente con 42 por ciento (n=18). El 58,1 por ciento (n=25) perteneció al grupo II. El hallazgo endoscópico predominante fue: Duodenitis tipo II con 30 por ciento (n=13). La Cromoendoscopia con AM no coloreó en 14 casos. En relación con los hallazgos histológicos, la coloración con HE reportó 30 por ciento (n=8) duodenitis leve, y metaplasia sola en 10 casos, usando HE y PAS. Al comparar los métodos de Cromoscopia con los histológicos el valor Kappa total fue K= 0.50, es decir, que la concordancia es considerada como buena para el diagnóstico de la MGD. La cromoendoscopia con AM es una técnica útil para identificar la MGD y puede ser utilizada para su identificación, evitando una subestimación de la existencia y extensión de la metaplasia

Evaluación de la infección por Helicobacter pylori en pacientes VIH positivos mediante ensayos inmunoenzimáticos y amplificación específica de ADN / Evaluation of infection by Helicobacter pylori in HIV positive patients trough enzyme immunoassay and specific amplification of DNA

El objetivo del presente trabajo fue valorar la eficacia de la detección de anticuerpos específicos anti Helicobacter pylori (H. pylori) vs técnicas de amplificación de ADN (PCR) como métodos diagnósticos de infección por H. pylori en pacientes VIH positivos. Se estudiaron 22 pacientes con infección por VIH, de 26 a 35 años, 17 masculinos, 55 por ciento con síntomas gastrointestinales, controlados en la Unidad de Inmunología de la CHET. Criterios de inclusión: mayores de 18 años, diagnóstico confirmado de infección por VIH (ELISA y WB), fenotipo celular, buenas condiciones generales. Se exigió consentimiento informado por escrito. Criterios de exclusión: diagnóstico previo de infección por H. pylori o tratamiento con antibióticos en los tres meses previos a su inclusión. La cuantificación de IgG anti H. pylori se realizó por métodos inmunoenzimáticos (ELISA). La muestra de mucosa gástrica se obtuvo por endoscopìa digestiva superior. La amplificación del ADN del H. pylori por PCR (Ensayo comercial Wizard SV Genomik y PCR Ready-Promega). En el procesamiento estadístico se utilizó como prueba de significación estadística el test exacto de Fisher, con un nivel de significación del 5 por ceinto (0,05). En 15 pacientes del grupo total se confirmó la presencia de anticuerpos anti H. pylori, sin asociación estadística con la presencia o no de sintomatología digestiva, ni con el número de linfocitos CD4 + en sangre periférica. También 15 pacientes fueron PCR positivos para el ADN del H. pylori, de los cuales, el 73,3 por ciento presentaron niveles de CD4+ por encima de 200 células. No se encontró asociación estadística entre la positividad de este método y los niveles de linfocitos CD4+. En 12 de los 15 pacientes con resultados positivos por PCR, se evidenciaron anticuerpos anti H. pylori, y entre los 7 pacientes con serología negativa para H. pylori, la PCR fue positiva en tres de ellos. En conclusión, la serología es un método diagnóstico eficaz de infección por H. pylori en pacientes VIH+, pero su negatividad no descarta la presencia de infección por este bacilo

Seroprevalencia de anticuerpos anti-virus de hepatitis C en trabajadores de la salud y empleados de instituciones sanitarias en Venezuela: informe preliminar / Seroprevalence of antibodies against the hepatitis C virus in health-care workers and employees of sanitary institutions in Venezuela: report preliminary

El objetivo del estudio fue estimar la prevalencia de anticuerpos contra el virus de la hepatitis C en trabajadores de la salud y empleados de instituciones sanitarias en Venezuela y correlacionar la presencia de los mismos con factores de riesgo conocidos para dicha infección. A través de un estudio epidemiológico, prospectivo, longitudinal y multicéntrico, se alcanzó una muestra de 13.788 individuos mayores de 16 años quienes laboran en instituciones de salud. Los anticuerpos específicos se detectaron por el método de ELISA. La detección del ácido ribonucleico del virus se realizó mediante la técnica de reacción en cadena de la polimerasa. Se determinó genotipo y carga viral. La prevalencia de anticuerpos anti virus de hepatitis C fue 1,3 por ciento (184/13.788), encontrándose genotipo 1 en el 70 por ciento de los pacientes. Siete (0,48 por ciento) de los médicos presentaron serología positiva. El riesgo relativo fue mayor de 1 para transfusiones y cirugía previa. En conclusión, en Venezuela la infección por virus de la hepatitis C es frecuente en trabajadores de la salud y empleados de instituciones sanitarias, siendo similar a la vista en la población de instituciones sanitarias, siendo similar a la vista en la población general y donantes de sangre. Los principales factores de riesgo fueron antecedentes de transfusiones y procedimientos quirúrgicos

Flocculation of fine fluorite particles with Corynebacterium xerosis and commercial long chain polymers

This work aimed to study, comparatively, the flocculation of fluorite particles with Corynebacterium xerosis cells and three commercial long chain polymers. Best flocculation results were obtained with cell of C. xerosis and with an anionic polyacrylamide. Both were effective in solids removal and water clarification, although flocculation with C. xerosis cells requires a higher dosage of reagent per mass unit of processed ore.

Avaliação da articulação têmporo-mandibular com eletrovibratografia em pacientes com artrite reumatóide. estudo clínico / Evaluation of the temporomandibular joints with eletrovibratography in patients with rheumatoid arthritis: clinical study

A artite reumatóide (AR) pode acometer quaisquer articulações sinoviais, dentre estas a articulação temporo-mandibular (ATM), com uma incidência de até 50por cento, manifestando-se com dor em 58 por cento e através da rigidez e crepitações em 42 por cento. O estudo para avaliar o envolvimento da ATM tem sido empregados métodos de imagem (R-x, CT e RMN), bem como outros métodos não invasivos, como o estudo dos sons articulares que podem se apresentar como 'Clicks' ou crepitações, cuja apresentação grafica, através da eletrovibratografia (EVB), pode ser obtida e estudada, com vantagem de ser rápido, indolor e de baixo custo. Os autores analisaram dezesseis pacientes, com AR pela EVB, tendo sido ainda constituido Grupo Controle (GC) de 20 pacientes sem morbidade prévia ou queixas em ATM. Ambos os grupos pertenciam ao sexo feminino, com idade média de 55,6 e 40,5 anos, respectivamente para o grupo com AR, as alterações estavam presentes em 13 pacientes, perfazendo 41,9por cento, não se observando relação com idade tempo de evolução ou número de articulações acometidas

Relación de la clasificación de Child-pugh con el parenquima hepático cuantificado a través del clearence de lidocaína / Relation of child pugh score with quantitative liver function tests determined through lidocaine clearence

Con el fin de relacionar la clasificación de Child-Pugh con la cuantificación de parénquina hepático funcionante determinada a través del clearence de lidocaína, se estudiaron 20 pacientes que ingresaron consecutivamente al Hospital Clínico Universitario de Caracas, con diagnóstico clínico, bioquímico e histológico de hepatopatía crónica de diferentes etiologías, y diferentes grados de severidad agrupándolos según los criterios de la clasificación de Child-Pugh. Previo consentimiento por escrito se administró lidocaína por vía oral y se realizó extracciones de sangre a los 15,30,60,120 y 360 minutos, y se investigó el clearence de lidocaína. Catorce pacientes (70 por ciento) pertenecieron al sexo masculino, con un rango etario entre 19 y 74 años. El 55 por ciento (11 casos) se encontraron como Child-Pugh C. Se utilizó un grupo control de 8 personas sanas, con un promedio de edad menor de 40 años, para garantizar función hepática indemne, obteniéndose como valor promedio de clearence de 30.07 u/Kg/ml, el cual se comparó con cada grupo de pacientes encontrando el clearence de lidocaína alterado aún en etapas tempranas de la patología hepática. El menor valor fue para el Child-Pugh A 8.65 u/Kg/ml, y el más alto para el C 12.76 u/Kg/ml. Hubo una diferencia estadísticamente significativa al comparar cada grupo. Se asocia esta variable farmacocinética con cada uno de los parámetros que conforma la clasificación de Child-Pugh, encontrando que los valores de albúmina de mayores de 3.5 mg/dl tuvieron el clearence promedio con el tiempo de protrombina donde observamos clearence más bajo 9.60 u/Kg/ml, igual situación se presentó con el tiempo de protumbrina, donde observamos clearence más bajo 9.60 u/Kg/ml para los pacientes con diferencias entre 1 a 4 segundos. Con bilirrubina entre 1 y 2 mg/dl presentaron clearence promedio más bajo 9.75 u/kg/ml. Con respecto a los pacientes que no presentaron ascítis el promedio del clearence fue el más alto de 13.28 u/Kg/ml con respecto a los pacientes con ascítis 8.50 u/Kg/ml. Y los que presentaron algún grado de encefalopatía el clearence promedio fue el más alto de 18.45 u/Kg/ml con respecto al grupo que no presentó trastornos de consciencia 10.4 u/Kg/ml. El clearence de lidocaína nos proporciona una medida más exacta del parénquima hepático funcionante, con lo que podemos obtener una medida fiel y confiable para el pronóstico, progresión y evolución del paciente con hepatopatía crónica

Correlación del ultrasonido abdominal endoscopia superior e histología con el metabolito de la lidocaina: MEGX / Correlation of abdominal ultrasound upper digestive endoscopy and histology with metabolite of lidocaine: MEGX test

Se correlacionaron los hallazgos endoscópicos, ultrasonido abdominal e histología, con los valores sanguíneos del producto principal del metabolismo hepático de la lidocaína: Monoetyglicynexilidide (MEGX), se estudiaron 16 pacientes que ingresaron al Hospital Universitario de Caracas, Servicio de Gastroenterología entre enero y diciembre de 1995, con diagnóstico de hepatopatía crónica. Se realizó la prueba a 9 pacientes controles, con evaluación previa y que no presentaron alteraciones. La endoscopia digestiva superior resultó normal en 4 pacientes (25 por ciento). Las várices esofágicas se observaron en 12 pacientes (75 por ciento). Se encontraron además otras alteraciones como gastropatía hipertensiva en 7 pacientes (43,75 por ciento) y várices fúndicas en 1 paciente (6,25 por ciento). Los hallazgos más frecuentes en ecografía abdominal, fueron los trastornos difusos de parénquima hepático en 12 pacientes el estudio fue normal (12,5 por ciento). No se realizó histología en 8 pacientes (50 por ciento), por cursar con alteraciones en las pruebas de coagulación. Los 8 pacientes (50 por ciento) a quienes se les realizó biopsia hepática, reportaron: cirrosis en 5 pacientes (62,80 por ciento), fibrosis portal en 2 pacientes (25 por ciento) y en 1 paciente (12,5 por ciento inflamatorio). Los pacientes con várices esofágicos Grado I, presentaron niveles de MEGX de 6.1ñ 0.0; Grado II: 12,5ñ 6.6 y Grado III: 14,2ñ 11.3; con una significación estadística p= 0.0020 y p= 0.0055 para las várices Grado II y III respectivamente. Los pacientes quienes al ultrasonido abdominal se les reportó cirrosis observaron valores promedios de MEGX de 17.2ñ 6.6; con una significancia estadística de 0.00027 para los trastornos difusos del parénquima hepático además de otros hallazgos; hipertensión portal más cirrosis: p= 0.0016; los trastornos difusos del perénquima hepático como único hallazgo: p= 0.29 y sin alteración P= 0.08. Al examinar los resultados del test MEGX en relación al índice de actividad histológica, se encontró que los pacientes con infiltrado inflamatorio: obtuvieron valores de MEGX promedio de 47.0ñ0.0; fibrosis portal: 18.3ñ5.6 y cirrosis hepática: 7.9ñ5.5, con una significancia estadística p=0.24 para la fibrosis portal y p=0.0062 para la cirrosis

El clearence de lidocaína y la histología hepática / Lidocaine clearence and liver histology

En vista de los actuales avances médicos y tratamientos quirúrgicos con respecto a las hepatopatías crónicas, y el incremento del desarrollo de pruebas no invasivas para estudiar la severidad y progresión de las mismas, estudiamos el Clearence de lidocaína y correlacionamos con los hallazgos histológicos y las pruebas bioquímicas en veinte pacientes que ingresaron consecutivamente al Hospital Clínico Universitario de Caracas con diagnóstico clínico, de laboratorio e histología de hepatopatía crónica, 5 casos (25 por ciento) cirrosis y 9 de ellos (45 por ciento) no se realizó biopsia, por alteraciones en las pruebas de coagulación. Todos los pacientes presentaron una disminución significativa del Clearence de lidocaína, siendo paralelo a la severidad de la enfermedad hepática. Se analizaron las pruebas bioquímicas con los hallazgos histológicos y observamos que sólo hubo alteración significativa en etapas tardias de la patología en la albúmina, bilirrubina total, y las transaminasas. El Clearence de lidocaína disminuye progresivamente, y con significancia estadística en forma paralela al daño histológico en las hepatopatías crónicas

Hemoperitoneo como presentación clínica de metástasis hepática de un coriocarcinoma / Hemoperitoneum as the clinical presentation of choriocarcinoma liver metastases

Reportamos un caso de Coriocarcinoma, en una paciente femenina de 29 años de edad que se presentó con un cuadro clínico de hemoperitoneo, con antecedente de embarazo a término normal y eutócico 8 meses antes. La tomografía axial computarizada de abdomen reporto múltiples imágenes nodulares a nivel de hígado y bazo. El estudio histológico del hígado reveló lesión neoplásica con un patrón coriocarcinomatoso, la cual se comprobó mediante la determinación inmunohistoquímica. Se revisa la literatura al respecto

Aspectos bacteriológicos del líquido ascitico en pacientes con cirrosis hepática / Bacteriological aspec of the ascitis fluid from patients with hepatic cirrhosis

Se estudiaron 35 pacientes que ingresaron consecutivamente, entre el 1 de enero de 1993 y 31 de diciembre de 1994, en el Hospital Universitario de Caracas, con cirrosis y ascitis. Como parte del protocolo de estudio se realizó paracentesis y análisis tanto bacteriológico como citoquímico del líquido ascítico. Venticuatro pacientes (68,57 por ciento) pertenecían al sexo masculino, con una mayor incidencia entre los 61 a 70 años de edad, 12 pacientes (50 por ciento). La etiología fue alcohólica en veintiun pacientes (87,5 por ciento). En el sexo femenino once pacientes (31,42 por ciento) presentaron mayor incidencia entre 41 a 50 años de edad (36,36 por ciento). La etiología fue viral en seis pacientes (54,5 por ciento). La ascitis se presentó en forma indolora y sin fiebre en seis (54,6 por ciento) hombres y, 16 mujeres (66,6 por ciento). La presencia de algún otro foco infeccioso se observó en el sexo masculino: 12 pacientes (50 por ciento) y, 1(9,14 por ciento) en el sexo femenino. En los seis pacientes con líquidos ascíticos infectados que representan el 17,14 por ciento, cuatro eran masculinos y dos femeninos, se encontró como principal germen causal la Escherichia coli en tres casos (50 por ciento). De los seis casos, tres desarrollaron peritonitis bacteriana espontánea y tres bacteriascitis. Los tres pacientes con peritonitis bacteriana espon tánea fallecieron: dos a causa de la peritonitis bacteriana y el otro supera el episodio y fallece posteriormente en un lapso de un mes debido a insuficiencia hepática

Leptospirosis en gastroenterologia: estudio de 14 casos en el Hospital Universitario de Caracas: 1989 - 1994 / Leptospirosis in gastroenterology study of 14 cases in the Hospital Universitario de Caracas 1989 - 1994

Se estudiaron 14 casos con diagnóstico definitivo de Leptospirosis por pruebas de microaglutinación de antígenos vivos (MAT) que fueron ingresados en el Hospital Universitario de Caracas entre 1989 y 1994. La mayoría fueron hospitalizados en el Servicio de Gastroenterología. El serovar más frecuente encontrado fue el tipo icterohemorragiae con 11 casos. Hubo un predominio marcado por el género masculino sobre el femenino 12/2 y la mayor parte de los pacientes se encontraron en el rango de edad entre 31 y 40 años. Los motivos de consulta más frecuentes fueron: fiebre (14), ictericia (10) y mialgias (10) mientras que los hallazgos al examen físico más relevantes fueron: ictericia (12), fiebre (11) y hepatomegalia (8). Todos los pacientes presentaron alteraciones de pruebas de laboratorio y dentro de éstas las amino-transferasas, la bilirrubina, el sedimento urinario, la creatinina, CPK y las plaquetas fueron las que con mayor frecuencia se alteraron. Solo en la mitad de los casos se sospechó el diagnóstico de Leptospirosis al momento del ingreso. Concluimos que si bien la Leptospirosis es una enfermedad infecciosa de amplia distribución mundial sólo una minoría de los casos se hospitalizan, su diagnóstico diferencial es dificíl debido a lo variado del cuadro clínico y a la disponibilidad de recursos de laboratorio. Es importante para el gastroenterólogo ya que la mayoría de las formas complicadas se presentan como cuadros de ictericia